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此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见hiReadsProcessor．

从454/Illumina数据中处理LM-PCR reads的函数。

Bioconductor版本:3.0

hiReadsProcessor包含一组功能，允许用户处理使用任何平台测序的LM-PCR产物。给定一个包含多路复用参数和样本元数据的excel/txt文件，该函数自动修剪适配器和识别基因组产物。基因组产物进一步进行QC和丰度定量。

作者:Nirav V Malani

维护者:Nirav V Malani

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“hiReadsProcessor”)

文档

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browseVignettes(“hiReadsProcessor”)

超文本标记语言	R脚本	简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	预处理，测序，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	Biostrings，GenomicAlignments，xlsx，BiocParallel，hiAnnotator， r (>= 3.0)
进口	sonicLength，plyr
链接
建议	knitr，testthat，BiocGenerics，rSFFreader
SystemRequirements	BLAT, JRE, UCSC hg18在2bit格式的BLAT
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	hiReadsProcessor_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	hiReadsProcessor_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	hiReadsProcessor_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	hiReadsProcessor_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/hiReadsProcessor/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hiReadsProcessor/
软件包下载报告	下载数据