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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ hiannotator”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅Hiannotator。
生物导体版本:3.0
Hiannotator包含一组功能,允许用户用自定义注释集对Granges对象进行注释。该软件包的基本理念是将两个granges对象(查询和主题)带有常见的seqnames(即染色体),并从seqnames中返回相关的注释,并从查询匹配的seqnames和行中的行(即基因或cpg群岛)中的行。)。该软件包带有三种类型的注释函数,它们计算出查询的位置是否为:在功能,靠近功能或定义窗口大小中的计数功能。此外,每个功能都配备了并行后端,以利用foreach软件包。此外,该软件包还配备了包装器功能,该功能找到了从通用数据框架制作Granges对象所需的适当列。
作者:nirav v malani
维护者:nirav v malani
引用(从r内,输入引用(“ hiannotator”)
):
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Browsevignettes(“ Hiannotator”)
html | R脚本 | 介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 基因组机,R(> = 2.10) |
进口 | foreach,,,,迭代器,,,,rtracklayer,,,,plyr,,,,BSGENOME,,,,GGPLOT2,,,,秤 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,多帕尔,,,,测试,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Hireadsprocessor |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | hiannotator_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | hiannotator_1.0.0.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | hiannotator_1.0.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | hiannotator_1.0.0.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/hiannotator/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hiannotator/ |
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