要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ hiannotator”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Hiannotator

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅Hiannotator

注释Granges对象的功能。

生物导体版本:3.0

Hiannotator包含一组功能,允许用户用自定义注释集对Granges对象进行注释。该软件包的基本理念是将两个granges对象(查询和主题)带有常见的seqnames(即染色体),并从seqnames中返回相关的注释,并从查询匹配的seqnames和行中的行(即基因或cpg群岛)中的行。)。该软件包带有三种类型的注释函数,它们计算出查询的位置是否为:在功能,靠近功能或定义窗口大小中的计数功能。此外,每个功能都配备了并行后端,以利用foreach软件包。此外,该软件包还配备了包装器功能,该功能找到了从通用数据框架制作Granges对象所需的适当列。

作者:nirav v malani

维护者:nirav v malani

引用(从r内,输入引用(“ hiannotator”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ Hiannotator”)

html R脚本 介绍
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 基因组机,R(> = 2.10)
进口 foreach,,,,迭代器,,,,rtracklayer,,,,plyr,,,,BSGENOME,,,,GGPLOT2,,,,
链接
建议 尼特,,,,多帕尔,,,,测试,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我 Hireadsprocessor
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 hiannotator_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 hiannotator_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) hiannotator_1.0.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) hiannotator_1.0.0.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/hiannotator/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/hiannotator/
软件包下载报告 下载统计

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