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此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本，请参阅GGBIO.。

基因组数据的可视化工具。

Biocometiond版本：3.0

GGBIO包扩展并专用了用于生物数据的图形语法。图形旨在回答常见的科学问题，特别是那些经常要求高吞吐基因组学数据的科学问题。适当的情况下支持所有核心生物导体数据结构。该包装支持特定基因组区域的详细视图，以及基因组概述。支持的概述包括表意外行为和大线性视图。高级绘图包括序列片段长度，边缘链接间隔到数据视图，不匹配堆叠和几个拼接摘要。

作者：腾飞尹，黛安库克，迈克尔劳伦斯

维护者：Gmail.com的Tengfei Yin

安装

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文件

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PDF.	r script.	第0部分：简介和快速入门
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	基础设施那软件那可视化
版本	1.14.0.
在生物导体中以来	BIOC 2.9（R-2.14）（4.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	方法，生物根系那ggplot2.（> = 1.0.0）
进口	网格，GRDEVICE，图形，统计数据，UTIL，Biovizbase.（> = 1.13.8），重塑2.那GTABLE.那BioBase.那S4Vectors.（> = 0.2.3），绞喉（> = 1.99.28），genomeinfodb.（> = 1.1.3），Genomicranges.（> = 1.17.40），生物仪器那RSAMTOOLS.（> = 1.17.28），基因管理（> = 1.1.16），bsgenome.那格拉底那秤那VariantAnnotation.（> = 1.11.4），HMISC.那rtracklayer.（> = 1.25.16），基因组法（> = 1.17.13），Organismdbi.那施说
链接到
建议	VSN.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那homo.sapiens.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那chipseq.那txdb.mmusculus.ucsc.mm9.knowngene.那kn那生物焦那testthat.
系统要求
加强
URL.	http://tengfei.github.com/ggbio/
取决于我	咖啡店那incansv.
进口我	derfinderplot那Fourcseq.那Genoview.那r那RegionReport.那ReportingTools.那Somaticsignatures.
建议我	Beadarray那Gwascat那互动神血那SomaticCencealterations
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	ggbio_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件	ggbio_1.14.0.zip.
Mac OS x 10.6（雪豹）	ggbio_1.14.0.tgz.
Mac OS x 10.9（mavericks）	ggbio_1.14.0.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/ggbio/tree/release-3.0
包短网址	http://biocidodder.org/packages/ggbio/
包裹下载报告	下载统计信息