要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genefter”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见genefilter.
Bioconductor版本:3.0
筛选基因的一些基本功能
作者:R. Gentleman, V. Carey, W. Huber, F. Hahne
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“genefilter”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genefter”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“genefilter”)
R脚本 | 独立过滤增加了检测差异表达基因的能力,Bourgon等人,PNAS (2010) | |
R脚本 | 独立过滤诊断 | |
R脚本 | 如何找到表达谱与指定基因相似的基因 | |
R脚本 | 使用基因过滤器功能从微阵列数据集中过滤基因 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.48.1 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | AnnotationDbi,注释,Biobase,图形,方法,统计,生存 |
链接 | |
建议 | 类,hgu95av2.db,tkWidgets,所有,中华民国,DESeq,pasilla,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | a4Base,ampliQueso,cellHTS,cellHTS2,魅力,CNTools,GeneMeta,Hiiragi2013,simpleaffy,股东价值分析 |
进口我 | affycoretools,affyQCReport,annmap,arrayQualityMetrics,类别,DESeq,DESeq2,DEXSeq,eisa,gCMAP,GGBase,GSRI,methyAnalysis,methylumi,minfi,MLInterfaces,PECA,phenoTest,林格,RNAinteractMAPK,simpleaffy,tilingArray,XDE |
建议我 | AffyExpress,注释,ArrayTools,BiocCaseStudies,生命网络,类别,categoryCompare,clusterStab,codelink,compcodeR,curatedBladderData,curatedCRCData,curatedOvarianData,雌激素,factDesign,ffpe,ffpeExampleData,gageData,GenomicFiles,GOstats,GSAR,GSEAlm,GSVA,logicFS,光民,MAQCsubset,MCRestimate,npGSEA,益生元,oneChannelGUI,phyloseq,pvac,qpgraph,rheumaticConditionWOLLBOLD,rtracklayer,siggenes,SSPA,topGO,XDE |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | genefilter_1.48.1.tar.gz |
Windows二进制 | genefilter_1.48.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | genefilter_1.48.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | genefilter_1.48.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/genefilter/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |