要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genefter”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

genefilter

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见genefilter

基因过滤器:从高通量实验中过滤基因的方法

Bioconductor版本:3.0

筛选基因的一些基本功能

作者:R. Gentleman, V. Carey, W. Huber, F. Hahne

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“genefilter”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“genefter”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“genefilter”)

PDF R脚本 独立过滤增加了检测差异表达基因的能力,Bourgon等人,PNAS (2010)
PDF R脚本 独立过滤诊断
PDF R脚本 如何找到表达谱与指定基因相似的基因
PDF R脚本 使用基因过滤器功能从微阵列数据集中过滤基因
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列软件
版本 1.48.1
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 AnnotationDbi注释Biobase,图形,方法,统计,生存
链接
建议 hgu95av2.dbtkWidgets所有中华民国DESeqpasillaBiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 a4BaseampliQuesocellHTScellHTS2魅力CNToolsGeneMetaHiiragi2013simpleaffy股东价值分析
进口我 affycoretoolsaffyQCReportannmaparrayQualityMetrics类别DESeqDESeq2DEXSeqeisagCMAPGGBaseGSRImethyAnalysismethylumiminfiMLInterfacesPECAphenoTest林格RNAinteractMAPKsimpleaffytilingArrayXDE
建议我 AffyExpress注释ArrayToolsBiocCaseStudies生命网络类别categoryCompareclusterStabcodelinkcompcodeRcuratedBladderDatacuratedCRCDatacuratedOvarianData雌激素factDesignffpeffpeExampleDatagageDataGenomicFilesGOstatsGSARGSEAlmGSVAlogicFS光民MAQCsubsetMCRestimatenpGSEA益生元oneChannelGUIphyloseqpvacqpgraphrheumaticConditionWOLLBOLDrtracklayersiggenesSSPAtopGOXDE
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 genefilter_1.48.1.tar.gz
Windows二进制 genefilter_1.48.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) genefilter_1.48.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) genefilter_1.48.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/genefilter/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心