##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“geecc”)

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见geecc．

基因集富集分析扩展到权数立方

Bioconductor版本:3.0

使用对数线性模型对两个(基于列联表)或三个类别(列联立方)的基因集富集进行超几何和卡方检验。分类可为差异表达基因、GO项、序列长度、GC含量、染色体位置、系层、....

作者:Markus Boenn

维护者:Markus Boenn < Markus。Boenn at ufz.de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“geecc”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“geecc”)

PDF	R脚本	geecc用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	BiologicalQuestion，去，GeneExpression，GeneSetEnrichment，微阵列，RNASeq，软件，StatisticalMethod，转录，WorkflowStep
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.0.0)，方法
进口	质量，hypergea(> = 1.2.3),gplots
链接
建议	hgu133plus2.db，GO.db，AnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	geecc_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	geecc_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	geecc_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	geecc_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/geecc/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/geecc/
软件包下载报告	下载数据