要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flowWorkspace”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

flowWorkspace

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见flowWorkspace

导入flowJo工作区到BioConductor和复制flowJo门控与flowCore

Bioconductor版本:3.0

这个包的设计是为了方便比较自动门控方法和在flowJo中进行的手动门控方法。这个包允许您将基本的flowJo工作区导入到BioConductor中,并使用flowCore功能从flowJo复制门控。将执行门控层次结构、样本组、补偿和转换,以便输出与flowJo分析匹配。

作者:Greg Finak, Mike Jiang

维护者:Greg Finak ,Mike Jiang

引文(从R内,输入引用(“flowWorkspace”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“flowWorkspace”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“flowWorkspace”)

PDF R脚本 将flowJo工作区导入R
超文本标记语言 R脚本 如何合并GatingSets
超文本标记语言 R脚本 如何绘制门控数据
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 安装

细节

biocViews DataImportDataRepresentationFlowCytometry预处理软件
版本 3.12.06
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.16.0),flowCore(> = 1.31.17),flowViz(> = 1.29.27),ncdfFlow(> = 2.11.34),gridExtra
进口 BiobaseBiocGenerics、图形、晶格,方法,统计,stats4, utils,RBGLXMLBiobaseIDPmisc开罗、工具、gridExtraRgraphvizdata.tableplyrlatticeExtraRcppRColorBrewer
链接 Rcpp
建议 testthatflowWorkspaceDataRSVGTipsDeviceknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 flowStatsopenCyto限定符
进口我 限定符
建议我 指南针flowCore
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 flowWorkspace_3.12.06.tar.gz
Windows二进制 flowWorkspace_3.12.06.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) flowWorkspace_3.12.06.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) flowWorkspace_3.12.06.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/flowWorkspace/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/flowWorkspace/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心