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fastseg
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅fastseg。
FastSeg-快速分割算法
生物导体版本：3.0
FastSeg实现了非常快速有效的分割算法。它具有与DNACOPY相似的功能（Olshen和Venkatraman 2004），但更快，更灵活。FastSeg可以从DNA微阵列和下一代测序中的数据分割数据，例如检测副本编号段。此外，它可以从RNA微阵列（例如瓷砖阵列）分割数据以识别成绩单。通常，它可以将给出的数据分割为矩阵或向量。各种数据格式可以用作fastSeg的输入，例如用于微阵列的表达式设置对象或用于测序数据的granges。FASTSEG的分割标准基于贝叶斯框架中的统计检验，即网络t检验（Baldi 2001）。速度是由于事实引起的，即FastSeg不需要采样，并且使用动态编程方法来计算片段的第一和更高阶段。
作者：Guenter Klambauer
维护者：Guenter Klambauer
引用（从r内，输入引用（“ fastseg”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ fastseg”）
| R脚本 | FastSeg：R包的手册 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，库务，，，，软件 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（4。5年） |
| 执照 | LGPL（> = 2.0） |
| 要看 | r（> = 2.13），基因组机，，，，生物酶 |
| 进口 | 图形，统计信息，iranges，，，，生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | DNACOPIGY，，，，奥利戈 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.bioinf.jku.at/software/fastseg/fastseg.html |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | fastSeg_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | fastSeg_1.12.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | fastSeg_1.12.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | fastSeg_1.12.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/fastseg/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fastseg/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
