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面部
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅面部。
基于特征的关联和基因 - 基因富集用于癌症的拷贝数改变分析
生物导体版本：3.0
Facopy是用于微调癌症CNA关联建模的R包装。关联直接以感兴趣的基因组特征进行测量，并且对于基因而言，由于数据的新内部处理，可以进行下游基因富集分析。该软件开辟了一种方法，可以系统地仔细检查跨肿瘤表型的CNA分布的差异，例如与肿瘤类型，位置和进展相关的CNA分布。当前，支持了11种不同方法的输出格式，这些方法分析了全基因组/外显子组测序和SNP微阵列的数据。还支持多种基因组，改变类型和变量类型。
作者：David Mosen-Ansorena
维护者：David Mosen-Ansorena
引用（从r内，输入引用（“ Facopy”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Facopy”）
| R脚本 | 面部 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，基因组变量，，，，微阵列，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（1。5年） |
| 执照 | CC BY-NC 4.0 |
| 要看 | r（> = 3.0），方法，CGDSR（> = 1.1.30），硬币（> = 1.0），GGPLOT2，，，，栅格，，，，facopy.annot |
| 进口 | 注释，，，，Data.Table，，，，剂量，，，，Factominer，，，，go.db，，，，gostats，，，，石墨，，，，Igraph，，，，iranges，，，，大量的，，，，nnet，，，，RESHAPE2，，，，rgraphviz，，，，秤 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
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| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | Facopy_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | facopy_1.0.0.0.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | Facopy_1.0.0.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | Facopy_1.0.0.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/facopy/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/facopy/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
