如果您有任何疑问。” /> 生物导体 - 外峰

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##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ exomeOmepeak”)

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外表

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅外表

Merip-Seq数据的基于外显子的Anlaysis:峰值通话和差分分析

生物导体版本:3.0

该软件包的开发用于分析Merip-Seq(MAA-Seq)的基于亲和力的表演组简短测序数据。它是基于Exomepeak Matlab软件包(Meng,Jia等。“基于外显子的分析RNA表观基因组测序数据。” Bioinformatics 29.12(2013)(2013):1565-1567。实验条件以揭示RNA甲基甲基转录后调节的动力学。外峰R包装接受并在统计学上支持多种生物学重复,内部删除PCR伪像和多映射读取,输出基于外显子组的结合位点(RNA甲基化位点)检测到差异后转录后RNA修饰位点之间两个实验条件的条件。百分比而不是绝对数量。该软件包仍在积极发展中,我们欢迎所有生物学和计算科学家进行各种合作和沟通。请随时与Jia Meng博士联系 如果你有任何问题。

作者:jia meng

维护者:jia meng

引用(从r内,输入引用(“ Exomepeak”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ exomeOmepeak”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ExomeOmepeak”)

PDF R脚本 外峰介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 高通量序列,,,,甲基,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 GPL-2
要看 rsamtools,,,,GenomicFeatures(> = 1.14.5),rtracklayer
进口
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包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 exomepeak_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 exomepeak_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) exomepeak_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) exomepeak_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/exomepeak/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/exomepeak/
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