##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("exomeCopy")

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见exomeCopy．

从外显子组测序读取深度检测拷贝数变异

Bioconductor版本:3.0

检测外显子组测序样本的拷贝数变异(CNV)，包括未配对样本。该包实现了一个隐藏的马尔可夫模型，该模型使用位置协变量，如背景读取深度和gc内容，以同时规范化和分割样本到固定拷贝计数的区域。

作者:Michael Love

维护者:Michael Love

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("exomeCopy")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“exomeCopy”)

PDF	R脚本	外显子组测序数据中的拷贝数变异检测
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，遗传学，测序，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor公司	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	IRanges，GenomicRanges，Rsamtools
进口	stats4、方法GenomeInfoDb
链接
建议	Biostrings
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	Rariant，SomaticCancerAlterations
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	exomeCopy_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	exomeCopy_1.12.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)	exomeCopy_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	exomeCopy_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/exomeCopy/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/exomeCopy/
软件包下载报告	下载数据