要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ememblvep”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

ememblvep

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅ememblvep

r接口到ENEMBL变体效应预测变量

生物导体版本:3.0

查询通过PERL API的Ensembl变体效应预测器

作者:valerie obenchain

维护者:valerie obenchain

引用(从r内,输入引用(“ ememblvep”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ememblvep”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ememblvep”)

PDF R脚本 ememblvep
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,软件
版本 1.6.2
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 艺术2.0
要看 方法,生物基因,,,,基因组机,,,,变体
进口 生物弦
链接
建议 运行
系统要求 必须安装Ensembl VEP(API版本78)和Perl软件包DBD :: MySQL。请参阅“ http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep/index.html”包装http://www.ensembl.org/indembl.org/index.html,请参见软件包readme和Ensembl网站。
增强
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取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Ensemblvep_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 ENSEMBLVEP_1.6.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) Ensemblvep_1.6.2.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) Ensemblvep_1.6.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/ensemblvep/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ensemblvep/
软件包下载报告 下载统计

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