要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ememblvep”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅ememblvep。
生物导体版本:3.0
查询通过PERL API的Ensembl变体效应预测器
作者:valerie obenchain
维护者:valerie obenchain
引用(从r内,输入引用(“ ememblvep”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ememblvep”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ememblvep”)
R脚本 | ememblvep | |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,软件 |
版本 | 1.6.2 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(3年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法,生物基因,,,,基因组机,,,,变体 |
进口 | 生物弦 |
链接 | |
建议 | 运行 |
系统要求 | 必须安装Ensembl VEP(API版本78)和Perl软件包DBD :: MySQL。请参阅“ http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep/index.html”包装http://www.ensembl.org/indembl.org/index.html,请参见软件包readme和Ensembl网站。 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Ensemblvep_1.6.2.tar.gz |
Windows二进制 | ENSEMBLVEP_1.6.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | Ensemblvep_1.6.2.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Ensemblvep_1.6.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/ensemblvep/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ensemblvep/ |
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