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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅EDGER。

R中数字基因表达数据的经验分析

生物导体版本：3.0

具有生物复制的RNA-SEQ和数字基因表达谱的差异表达分析。使用基于负二项式分布的经验贝叶斯估计和精确测试。还适用于与其他类型的基因组规模计数数据的差异信号分析。

作者：yunshun chen ，戴维斯·麦卡锡（Davis McCarthy），aaron lun ，xiaobei zhou zhou zhou ，gordon smyth

维护者：yunshun chen ，aaron lun ，马克·罗宾逊（Mark Robinson>，gordon smyth

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

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文档

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Browsevignettes（“ Edger”）

PDF	R脚本	Edger Vignette
PDF		Edgerusersguide.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	替代方案，，，，批处理效应，，，，贝叶斯，，，，chipseq，，，，聚类，，，，覆盖范围，，，，差异性，，，，差速器，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，多重组合，，，，正常化，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，回归，，，，智者，，，，测序，，，，软件，，，，时间科，，，，转录
版本	3.8.6
在生物导体中	Bioc 2.3（R-2.8）（7。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 2.15.0），林玛
进口	方法
链接
建议	大量的，，，，Statmod，花键，Locfit，，，，克恩斯门茶
系统要求
增强
URL	http://bioinf.wehi.edu.au/edger
取决于我	dbchip，，，，埃达，，，，蝠ta，，，，甲基mn，，，，mlseq，，，，Ruvseq，，，，TCC，，，，翻译
进口我	ampliqueso，，，，arrayexpresshts，，，，compcoder，，，，CSAW，，，，DegReport，，，，差异，，，，DSS，，，，EasyRnaseq，，，，埃达，，，，Erccdashboard，，，，htsfilter，，，，Medips，，，，metaseqr，，，，msmstests，，，，repitools，，，，报告工具，，，，RNASEQMAP，，，，Systempiper，，，，topaseq，，，，Tweedeseq
建议我	贝塞克，，，，bitseq，，，，分类，，，，克洛诺特犬，，，，CQN，，，，EDASEQ，，，，量规，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，Goseq，，，，grohmm，，，，GSAR，，，，GSVA，，，，Leebamviews，，，，甲基小姐，，，，Onechannelgui，，，，帕西拉，，，，SSPA
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	edger_3.8.6.tar.gz
Windows二进制	edger_3.8.6.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	edger_3.8.6.tgz
Mac OS X 10.9（Mavericks）	edger_3.8.6.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/edger/tree/release-3.0
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/edger/
软件包下载报告	下载统计