要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ cn.farms”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅CN.Farms。
生物导体版本:3.0
该软件包实现了CN.FARMS算法的拷贝数变化(CNV)分析。CN.FARMS允许分析最常见的Affymetrix(250K-SNP6.0)阵列类型,支持使用雪和FF的高性能计算。
作者:Andreas Mitterecker,Djork-Arne Clevert
维护者:Andreas Mitterecker
引用(从r内,输入引用(“ CN.Farms”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CN.Farms”)
R脚本 | CN.Farms:R包的手册 | |
参考手册 |
生物浏览 | 库务,,,,微阵列,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(5年) |
执照 | LGPL(> = 2.0) |
要看 | r(> = 3.0),生物酶, 方法,ff,,,,寡群,,,,雪 |
进口 | DBI,,,,affxparser,,,,奥利戈,,,,DNACOPIGY,,,,预处理,,,,格子 |
链接 | |
建议 | pd.mapping250k.Sty,,,,pd.mapping250k.nsp,,,,pd.Genomewidenp.5,,,,pd.Genomewidenp.6 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | cn.farms_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | cn.farms_1.14.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | cn.farms_1.14.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | cn.farms_1.14.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/cn.farms/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |