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克洛诺特犬

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅克洛诺特犬

T细胞抗原受体序列的高通量分析

生物导体版本:3.0

T细胞抗原受体序列的高通量分析编码T细胞受体的基因是通过体细胞重组产生的,从而产生了V,(D)和J段的巨大组合。重组期间的其他过程在V和J段之间创造了额外的序列多样性。总体而言,此超变量区域称为CDR3环。。该软件包的目的是从多个序列文库中处理和定量分析数百万个称为clonotypes的V-CDR3-J组合。

作者:Charles Plessy 的Plessy>

维护者:Charles Plessy

引用(从r内,输入引用(“ clonotyper”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ Clonotyper”)

html R脚本 Clonotyper用户指南
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 测序,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年)
执照 文件许可证
要看
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建议 生物基因,,,,EDGER,,,,尼特,,,,PVCLUST,,,,运行,,,,素食主义者
系统要求
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包源 clonotyper_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 clonotyper_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) clonotyper_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) clonotyper_1.4.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/clonotyper/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/clonotyper/
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