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该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅克洛诺特犬。
生物导体版本:3.0
T细胞抗原受体序列的高通量分析编码T细胞受体的基因是通过体细胞重组产生的,从而产生了V,(D)和J段的巨大组合。重组期间的其他过程在V和J段之间创造了额外的序列多样性。总体而言,此超变量区域称为CDR3环。。该软件包的目的是从多个序列文库中处理和定量分析数百万个称为clonotypes的V-CDR3-J组合。
作者:Charles Plessy
维护者:Charles Plessy
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Browsevignettes(“ Clonotyper”)
html | R脚本 | Clonotyper用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 测序,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(2。5年) |
执照 | 文件许可证 |
要看 | |
进口 | 方法 |
链接 | |
建议 | 生物基因,,,,EDGER,,,,尼特,,,,PVCLUST,,,,运行,,,,素食主义者 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | clonotyper_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | clonotyper_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | clonotyper_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | clonotyper_1.4.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/clonotyper/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/clonotyper/ |
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