##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cleanUpdTSeq”)

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cleanUpdTSeq．

该包将假定的多聚腺苷酸位点分类为true或false/内部寡核苷酸引物。

Bioconductor版本:3.0

该包使用朴素贝叶斯分类器(来自e1071)根据斑马鱼的训练数据将概率值分配给假定的多聚腺苷酸位点(pA位点)。这将允许用户将真实的、生物学上相关的pA位点从虚假的、寡核苷酸引物的pA位点中分离出来。

作者:Sarah Sheppard，欧建宏，Nathan Lawson，朱丽华

维护者:Sarah Sheppard ;欧建宏<建宏。Ou at umassmed.edu>;朱丽华<朱丽。在umassmed.edu>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cleanUpdTSeq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cleanUpdTSeq”)

PDF	R脚本	cleanUpdTSeq装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，遗传学，SequenceMatching，测序，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.15)，BiocGenerics(> = 0.1.0),BSgenome，BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7，GenomicRanges，seqinr，e1071
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	cleanUpdTSeq_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	cleanUpdTSeq_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	cleanUpdTSeq_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	cleanUpdTSeq_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/cleanUpdTSeq/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cleanUpdTSeq/
软件包下载报告	下载数据