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此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见chipseq．

chipseq:用于分析chipseq数据的包

Bioconductor版本:3.0

帮助处理chipseq实验的短读取数据的工具

作者:Deepayan Sarkar, Robert Gentleman, Michael Lawrence，姚紫珍

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“chipseq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“chipseq”)

PDF	R脚本	一个样本ChIP-Seq分析工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，报道，DataImport，质量控制，测序，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10)，方法，BiocGenerics(> = 0.1.0),S4Vectors(> = 0.0.1),IRanges(> = 1.99.1),GenomicRanges(> = 1.17.7),BSgenome，ShortRead
进口	方法,BiocGenerics，IRanges，BSgenome，GenomicRanges，晶格，ShortRead,统计数据
链接
建议	GenomicFeatures，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	平
进口我	ChIPQC，HTSeqGenie
建议我	ggbio，oneChannelGUI
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	chipseq_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	chipseq_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	chipseq_1.16.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	chipseq_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/chipseq/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipseq/
软件包下载报告	下载数据