要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ chimera”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅嵌合体。
生物导体版本:3.0
该软件包有助于融合产品事件的表征。它允许从以下融合发现器导入融合数据:Chimerascan,Bellerophontes,Duncuse,FusionFinder,FusionHunter,Mapsplice,Tophat-Fusion,Tophat-Fusion-Post,Tophat-Fusion-Post,FusionMap,fusionMap,star,rsubread,rsubread,fusionCatcher,FusionCatcher。
作者:Raffaele A Calogero,Matteo Carrara,Marco Beccuti,Francesca Cordero
维护者:raffaele a calogero
引用(从r内,输入引用(“嵌合体”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“嵌合体”)
R脚本 | 嵌合体 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.8.5 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(3年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 生物酶,,,,基因组机(> = 1.13.3),rsamtools(> = 1.13.1),基因组签名, 方法,AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物比较,,,,rbowtie,,,,Geneplotter |
系统要求 | 某些功能需要星级,Tophat,Bowtie和Samtools |
增强 | rsubread,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db |
URL | |
取决于我 | Onechannelgui |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Chimera_1.8.5.tar.gz |
Windows二进制 | Chimera_1.8.5.5.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | Chimera_1.8.5.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Chimera_1.8.5.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/chimera/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chimera/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |