要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ chimera”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

嵌合体

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅嵌合体

用于融合产品的辅助分析的包装

生物导体版本:3.0

该软件包有助于融合产品事件的表征。它允许从以下融合发现器导入融合数据:Chimerascan,Bellerophontes,Duncuse,FusionFinder,FusionHunter,Mapsplice,Tophat-Fusion,Tophat-Fusion-Post,Tophat-Fusion-Post,FusionMap,fusionMap,star,rsubread,rsubread,fusionCatcher,FusionCatcher。

作者:Raffaele A Calogero,Matteo Carrara,Marco Beccuti,Francesca Cordero

维护者:raffaele a calogero

引用(从r内,输入引用(“嵌合体”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ chimera”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“嵌合体”)

PDF R脚本 嵌合体
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基础设施,,,,软件
版本 1.8.5
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶,,,,基因组机(> = 1.13.3),rsamtools(> = 1.13.1),基因组签名, 方法,AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
进口
链接
建议 生物比较,,,,rbowtie,,,,Geneplotter
系统要求 某些功能需要星级,Tophat,Bowtie和Samtools
增强 rsubread,,,,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db
URL
取决于我 Onechannelgui
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Chimera_1.8.5.tar.gz
Windows二进制 Chimera_1.8.5.5.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) Chimera_1.8.5.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) Chimera_1.8.5.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/chimera/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chimera/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心