##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“blima”)

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见blima.

封装用于检测器(珠)水平上Illumina微阵列的预处理和分析。

Bioconductor版本:3.0

软件包blima包括几种用于Illumina微阵列数据预处理的算法。它专注于珠层分析，并为不等长矢量的分位数归一化提供了一种新的方法。它提供了多种方法的背景校正，包括背景减法，RMA，如卷积和背景离群值去除。在珠层上实现方差稳定转换。也有数据汇总的实现方法。它还提供了在差异表达测试的检测器(珠)水平和探针水平上执行t测试的方法。

作者:Vojtech Kulvait

维护者:Vojtech Kulvait < Kulvait at gmail.com>

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“blima”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“blima”)

PDF	R脚本	blima.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,归一化,预处理,软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.0)
进口	beadarray(> = 2.0.0),Biobase(> = 2.0.0),BiocGenerics， grDevices, stats, graphics
链接
建议	xtable,blimaTestingData,BiocStyle,illuminaHumanv4.db,光民
SystemRequirements
增强了
URL	https://bitbucket.org/kulvait/blima
取决于我
进口我
建议我	blimaTestingData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	blima_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	blima_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	blima_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	blima_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/blima/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/blima/
包下载报告	下载数据