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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅变体。

遗传变异的注释

生物导体版本：3.0

注释变体，计算氨基酸编码变化，预测编码结果

作者：Valerie Obenchain [AUT，CRE]，Martin Morgan [AUT]，Michael Lawrence [AUT]，Stephanie Gogarten [CTB]

维护者：valerie obenchain

安装

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文档

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browsevignettes（“变体”）

PDF	R脚本	FilterVCF概述
PDF	R脚本	变体介绍
PDF		参考手册
文本		消息
视频		读取VCF数据

细节

生物浏览	注解，，，，DataImport，，，，遗传学，，，，SNP，，，，测序，，，，软件
版本	1.12.9
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（4。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.8.0），方法，生物基因（> = 0.7.7），GenomeInfodB（> = 1.1.3），基因组机（> = 1.17.40），rsamtools（> = 1.17.26）
进口	utils，DBI，，，，Zlibbioc，，，，生物酶，，，，S4VECTORS（> = 0.2.3），iranges（> = 2.0.1），xvector（> = 0.5.6），生物弦（> = 2.33.5），AnnotationDbi（> = 1.27.9），BSGENOME，，，，rtracklayer（> = 1.25.16），GenomicFeatures（> = 1.17.13）
链接	S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦，，，，rsamtools
建议	运行，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109，，，，sift.hsapiens.dbsnp132，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，snpstats，，，，GGPLOT2，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我	ampliqueso，，，，CGDV17，，，，CNVRD2，，，，Deepsnv，，，，ememblvep，，，，htseqgenie，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，稀有，，，，sift.hsapiens.dbsnp132，，，，sift.hsapiens.dbsnp137，，，，躯体签名，，，，变体工具
进口我	Biovizbase，，，，宇宙67，，，，CustomProdb，，，，funcisnp，，，，GGBIO，，，，ggtools，，，，GMAPR，，，，mafdb.all.wgs.phase1.release.v3.20101123，，，，mafdb.all.wgs.phase1.release.v3.20101123，，，，mafdb.esp6500si.v2.ssa137.dbsnp138，，，，mafdb.esp6500si.v2.ssa137.dbsnp138，，，，R453plus1toolbox，，，，Seqarray，，，，变体滤波器
建议我	基因组机，，，，Gwastools，，，，三人组，，，，vtpnet
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	variantAnnotation_1.12.9.tar.gz
Windows二进制	variantAnnotation_1.12.9.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	variantantation_1.12.9.tgz
Mac OS X 10.9（Mavericks）	variantantation_1.12.9.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/variantannotation/tree/release-3.0
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/variantannotation/
软件包下载报告	下载统计