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topaseq
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅topaseq。
用于基于拓扑的RNASEQ数据的途径分析包
生物导体版本：3.0
实施七种用于基于拓扑的RNASEQ和微阵列数据的方法分析：SPIA，DEGRAPH，TOPOLOGYGSA，TAPPA，TBS，TBS，PWEA和单个途径的可视化工具。
作者：伊万娜·伊纳托娃（Eva Budinska）
维护者：ivana ihnatova
引用（从r内，输入引用（“ topaseq”））：
安装
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文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ topaseq”）
| R脚本 | 用于基于拓扑的MicroAray和RNA-seq数据的R套件 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，NetworkEnrichment，，，，途径，，，，rnaseq，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.0.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（1。5年） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 要看 | 石墨，，，，Grbase，，，，图形，，，，Locfit |
| 进口 | r.utils，，，，EDGER，，，，deseq2，，，，基因组机，，，，Igraph，，，，deseq，，，，字段，，，，林玛，，，，Deachertimos，，，，Spia，，，，快船，，，，拓扑结构 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，Gagedata，，，，rgraphviz，，，，degraph |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | topaseq_1.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | topaseq_1.0.1.1.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | topaseq_1.0.1.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | topaseq_1.0.1.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/topaseq/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/topaseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
