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目标扫描

此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅目标扫描

TargetScore:使用Microrna-过度表达数据和序列信息进行MicroRNA目标

Biocometiond版本:3.0

通过概率地建模似乎微小RNA过表达折叠变化和基于序列的分数来推断微瘤靶的后部分布。variaitonal贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)应用于日志折叠变化和序列分数,以获得潜在变量的后侧是miRNA靶标。最终的目标刻度被计算为在所有特征上由目标组件的平均后侧加权的矩形变换的折叠变化。

作者:岳丽

维护者:yue li

引文(从R内,输入引文(“TargetScore”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)bioclite(“targetscore”)

文件

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Browsevignettes(“TargetScore”)

PDF. r script. TargetScore:使用Microrna-过度表达数据和序列信息进行MicroRNA目标
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 软件miRNA.
版本 1.4.0.
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(2.5岁)
执照 GPL-2
依靠 Pracma.矩阵
进口
链接到
建议 TargetScoreData.贡献BioBase.地理曲线
系统要求
加强
URL. http://www.cs.utortono.ca/~yueli/software.html.
取决于我
进口我
建议我 TargetScoreData.
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 targetscore_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件 targetscore_1.4.0.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹) targetscore_1.4.0.tgz.
Mac OS x 10.9(mavericks) targetscore_1.4.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocondion-mirror/targetscore/tree/release-3.0
包短网址 http://biocidodder.org/packages/targetScore/
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