要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SimBindProfiles”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SimBindProfiles.
Bioconductor版本:3.0
SimBindProfiles识别基因组平铺阵列数据中常见和唯一的结合区域。这个包不依赖于峰值调用,而是直接比较在同一数组平台上处理的绑定概要文件。它实现了一个简单的阈值方法,从而允许检索数据集之间的共同和差异绑定区域,以及补偿和增加绑定的事件。
作者:贝蒂娜·费舍尔,恩里科·费雷罗,罗伯特·斯托尼克,史蒂夫·拉塞尔
维护者:Bettina Fischer
引文(从R内,输入引用(“SimBindProfiles”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SimBindProfiles”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SimBindProfiles”)
R脚本 | SimBindProfiles:相似的绑定配置文件,识别阵列基因组平铺阵列数据中常见和唯一的区域 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 2.10),方法,林格 |
进口 | limma,mclust,Biobase |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SimBindProfiles_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | SimBindProfiles_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SimBindProfiles_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | SimBindProfiles_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/SimBindProfiles/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SimBindProfiles/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |