要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“STRINGdb”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

STRINGdb

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见STRINGdb

检索相互作用蛋白质数据库的搜索工具

Bioconductor版本:3.0

STRINGdb包为STRING蛋白质-蛋白质相互作用数据库(http://www.string-db.org)提供了用户友好的界面。

作者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb- sibling .ch>

维护者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib。ch>,亚历山大·罗斯<亚历山大。罗斯在gmail.com>,克里斯蒂安·冯·梅林在imls.uzh。ch>,迈克尔库恩<迈克尔。库恩在biotec.tu-dresden.de>, Lars J Jensen < Lars .juhl。詹森在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“STRINGdb”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“STRINGdb”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“STRINGdb”)

PDF R脚本 STRINGdb装饰图案
PDF 参考手册

细节

biocViews 网络软件
版本 1.5.5
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.14.0),pngsqldfplyrigraphRCurlplotrix、方法、RColorBrewergplots哈希
进口
链接
建议 RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 scsR
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 STRINGdb_1.5.5.tar.gz
Windows二进制 STRINGdb_1.5.5.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) STRINGdb_1.5.5.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) STRINGdb_1.5.5.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/STRINGdb/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/STRINGdb/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心