要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“STRINGdb”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见STRINGdb.
Bioconductor版本:3.0
STRINGdb包为STRING蛋白质-蛋白质相互作用数据库(http://www.string-db.org)提供了用户友好的界面。
作者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb- sibling .ch>
维护者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib。ch>,亚历山大·罗斯<亚历山大。罗斯在gmail.com>,克里斯蒂安·冯·梅林在imls.uzh。ch>,迈克尔库恩<迈克尔。库恩在biotec.tu-dresden.de>, Lars J Jensen < Lars .juhl。詹森在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“STRINGdb”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“STRINGdb”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“STRINGdb”)
R脚本 | STRINGdb装饰图案 | |
参考手册 |
biocViews | 网络,软件 |
版本 | 1.5.5 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.14.0),png,sqldf,plyr,igraph,RCurl,plotrix、方法、RColorBrewer,gplots,哈希 |
进口 | |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | scsR |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | STRINGdb_1.5.5.tar.gz |
Windows二进制 | STRINGdb_1.5.5.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | STRINGdb_1.5.5.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | STRINGdb_1.5.5.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/STRINGdb/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/STRINGdb/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |