要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPchip.
Bioconductor版本:3.0
这个包定义了可视化高通量基因组数据的方法
作者:Robert Scharpf
维护者:Robert Scharpf
引文(从R内,输入引用(“SNPchip”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SNPchip”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SNPchip”)
R脚本 | 绘制染色体组型 | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
版本 | 2.12.0 |
在Bioconductor | BioC 2.0 (R-2.5)(9年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.14.0) |
进口 | 图形,晶格、网格foreach, utils,方法,oligoClasses(> = 1.21.12),Biobase,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | crlmm(> = 1.17.14),RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | doSNOW,VanillaICE(> = 1.21.24),RColorBrewer |
URL | http://www.biostat.jhsph.edu/~iruczins/software/snpchip.html |
全靠我 | mBPCR |
进口我 | crlmm,phenoTest |
建议我 | 类别,MinimumDistance,VanillaICE |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SNPchip_2.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | SNPchip_2.12.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SNPchip_2.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | SNPchip_2.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/SNPchip/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |