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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Roleswitch。

推断miRNA-mRNA交互使用成对的表达数据从一个样本

Bioconductor版本:3.0

推断概率MiRNA-mRNA互动的签名(承诺)使用成对的表达数据从一个样本。Roleswitch运行在两个阶段的概率推断mRNA (microrna)的目标(“目标”)的microrna (mRNA),考虑到所有的mRNA的表达(microrna)由于其潜在的竞争同样的microrna (mRNA)。由于在细胞内动态microrna的镇压,Roleswitch假定总mRNA转录水平高于观察(平衡)mRNA水平和迭代更新每个信使rna的转录总目标基于上述推理。注:在本文中,我们使用承诺模型名称和推断出分数的名字。

作者:李曰

维护人员:李曰< yueli cs.toronto.edu >

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PDF	R脚本	Roleswitch
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件,microrna的
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),pracma,重塑,plotrix,微,biomaRt,Biostrings,Biobase,DBI
进口
链接
建议	ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/ ~ yueli / roleswitch.html
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	Roleswitch_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	Roleswitch_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	Roleswitch_1.4.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	Roleswitch_1.4.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/roleswitch/tree/release - 3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Roleswitch/
包下载报告	下载数据