要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RUVSeq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RUVSeq

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RUVSeq

从RNA-Seq数据中去除不需要的变化

Bioconductor版本:3.0

该包实现了Risso等人(2014)的去除不需要的变异(RUV)方法,用于样本之间RNA-Seq读取计数的规范化。

作者:Davide Risso和Sandrine Dudoit

维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“RUVSeq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RUVSeq”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RUVSeq”)

PDF R脚本 RUVSeq:从RNA-Seq数据中去除不需要的变异
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression预处理RNASeq软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 EDASeq(> = 1.99.1),刨边机
进口 方法,质量
链接
建议 BiocStyleknitrRColorBrewerzebrafishRNASeqDESeq
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RUVSeq_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 RUVSeq_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) RUVSeq_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) RUVSeq_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RUVSeq/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RUVSeq/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心