要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RUVSeq”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RUVSeq.
Bioconductor版本:3.0
该包实现了Risso等人(2014)的去除不需要的变异(RUV)方法,用于样本之间RNA-Seq读取计数的规范化。
作者:Davide Risso和Sandrine Dudoit
维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“RUVSeq”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RUVSeq”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RUVSeq”)
R脚本 | RUVSeq:从RNA-Seq数据中去除不需要的变异 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,预处理,RNASeq,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | EDASeq(> = 1.99.1),刨边机 |
进口 | 方法,质量 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,RColorBrewer,zebrafishRNASeq,DESeq |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RUVSeq_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | RUVSeq_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RUVSeq_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | RUVSeq_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RUVSeq/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RUVSeq/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |