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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅研制。

重建的转录网络和分析主监管机构

Bioconductor版本:3.0

这个包提供了类和方法转录网络推理和分析。调节器转录因子活性的评估条件互信息,和主监管机构被映射到表型使用不同的策略,例如,基因集富集,阴影和协同分析。此外,主监管机构可以使用eQTL / VSE与遗传标记分析,利用人类基因组单体型的块结构映射到为了探索风险snp在GWAS研究中确定。

作者:毛罗·卡斯特罗,鑫Wang Florian Markowetz迈克尔·弗莱彻和Kerstin迈耶

维护人员:毛罗·卡斯特罗< mauro.a。卡斯特罗在gmail.com >

安装

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PDF	R脚本	主要装饰图案:重建和分析转录网络的R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GeneticVariability,GraphAndNetwork,NetworkAnalysis,NetworkEnrichment,NetworkInference,单核苷酸多态性,软件
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.15),方法,igraph
进口	红色的,minet,雪,limma,data.table,ff,车,IRanges
链接
建议	HTSanalyzeR,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	http://dx.doi.org/10.1038/ncomms3464
取决于我	Fletcher2013b
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	RTN_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	RTN_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	RTN_1.4.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	RTN_1.4.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/rtn/tree/release - 3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RTN/
包下载报告	下载数据