要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RDAVIDWebService”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本,请参见RDAVIDWebService。
Bioconductor版本:3.0
从注释、可视化和集成发现(DAVID)数据库中检索数据的工具,使用Web服务到R对象中。这个软件包提供了DAVID网站的主要功能,包括:i)用户友好的连接,上传基因/背景列表,改变基因/背景位置,选择当前物种,选择注释等。ii)提交的基因列表报告,注释分类摘要,基因/术语簇,功能注释图,功能注释表
作者:Cristobal Fresno和Elmer A. Fernandez
维护者:Cristobal Fresno
引文(从R中输入引用(“RDAVIDWebService”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RDAVIDWebService”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RDAVIDWebService”)
R脚本 | RDAVIDWebService:一个通用的R接口 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GraphAndNetwork,软件,可视化 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 2.14.1),方法图,GOstats,ggplot2 |
进口 | 类别,GO.db,RBGL,rJava |
链接 | |
建议 | Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/ |
取决于我 | CompGO |
进口我 | |
建议我 | FGNet |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | RDAVIDWebService_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | RDAVIDWebService_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | RDAVIDWebService_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | RDAVIDWebService_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RDAVIDWebService/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RDAVIDWebService/ |
包下载报告 | 下载数据 |