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在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅r453plus1toolbox.。
Biocometiond版本:3.0
R453Plus1工具箱包括用于分析Roche 454测序平台生成的数据的有用功能。它增加了质量保证的功能以及检测到的变体的注释和可视化,补充了Roche发货的软件工具与其产品。此外,提供了用于检测结构变型的管道。
作者:Hans-Ulrich Klein,Christoph Bartenhagen,Christian Ruckert
维护者:Hans-Ulrich Klein
引文(从R内,输入引文(“r453plus1toolbox”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“R453PLUS1TOOLBOX”)
PDF. | r script. | 用于从Roche的基因组序列系统中导入和分析数据的包 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | DataImport.那datarepresentation那基础设施那QualityControl.那报告写作那测序那软件那可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.7(R-2.12)(5.5岁) |
执照 | LGPL-3 |
依靠 | r(> = 2.12.0),BioBase.那生物仪器那Genomicranges. |
进口 | 生物根系(> = 0.1.3),生物雕那bsgenome.那绞喉那xvector., 方法,R2HTML那RSAMTOOLS.那缩短那VariantAnnotation.那xtable., 工具,教学编辑 |
链接到 | |
建议 | rtracklayer.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那bsgenome.scerevisiae.ucsc.saccer2. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | r453plus1toolbox_1.16.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | r453plus1toolbox_1.16.0.zip.(32-&64位) |
Mac OS x 10.6(雪豹) | r453plus1toolbox_1.16.0.tgz. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | r453plus1toolbox_1.16.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/r453plus1toolbox/tree/release-3.0 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/r453plus1toolbox/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |