要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocidodder.org/bioclite.r”)bioclite(“r453plus1toolbox”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

r453plus1toolbox.

此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅r453plus1toolbox.

一种用于从Roche的基因组序列系统系统导入和分析数据的包。

Biocometiond版本:3.0

R453Plus1工具箱包括用于分析Roche 454测序平台生成的数据的有用功能。它增加了质量保证的功能以及检测到的变体的注释和可视化,补充了Roche发货的软件工具与其产品。此外,提供了用于检测结构变型的管道。

作者:Hans-Ulrich Klein,Christoph Bartenhagen,Christian Ruckert

维护者:Hans-Ulrich Klein

引文(从R内,输入引文(“r453plus1toolbox”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocidodder.org/bioclite.r”)bioclite(“r453plus1toolbox”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“R453PLUS1TOOLBOX”)

PDF. r script. 用于从Roche的基因组序列系统中导入和分析数据的包
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. DataImport.datarepresentation基础设施QualityControl.报告写作测序软件可视化
版本 1.16.0
在生物导体中以来 BIOC 2.7(R-2.12)(5.5岁)
执照 LGPL-3
依靠 r(> = 2.12.0),BioBase.生物仪器Genomicranges.
进口 生物根系(> = 0.1.3),生物雕bsgenome.绞喉xvector., 方法,R2HTMLRSAMTOOLS.缩短VariantAnnotation.xtable., 工具,教学编辑
链接到
建议 rtracklayer.bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19bsgenome.scerevisiae.ucsc.saccer2.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 r453plus1toolbox_1.16.0.tar.gz.
Windows二进制文件 r453plus1toolbox_1.16.0.zip.(32-&64位)
Mac OS x 10.6(雪豹) r453plus1toolbox_1.16.0.tgz.
Mac OS x 10.9(mavericks) r453plus1toolbox_1.16.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/r453plus1toolbox/tree/release-3.0
包短网址 http://biocidodder.org/packages/r453plus1toolbox/
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文件»

生物体

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支持»

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