安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“QuasR”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

QuasR

这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅QuasR

量化和注释在短时间内读取R

Bioconductor版本:3.0

这个包提供了一个框架的量化和分析短的读取。它涵盖了一个完整的工作流从原始序列读取,校准和质量控制图的创建,量化的基因组区域。

作者:安妮塔,我们针对Dimos Gaiditzis和迈克尔·施

维护人员:迈克尔Stadler <迈克尔。施在fmi.ch >

从内部引用(R,回车引用(“QuasR”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“QuasR”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“QuasR”)

PDF R脚本 介绍QuasR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq,遗传学,MethylSeq,预处理,RNASeq,测序,软件
版本 1.6.2
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证 GPL-2
取决于 平行,GenomicRanges(> = 1.13.3),Rbowtie
进口 方法,zlibbioc,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,BiocInstaller,Biobase,Biostrings,GenomicRanges,BSgenome,Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicFeatures(> = 1.17.13),ShortRead(> = 1.19.1),GenomicAlignments
链接 Rsamtools
建议 Rsamtools,rtracklayer,Gviz,RUnit,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 QuasR_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 QuasR_1.6.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) QuasR_1.6.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) QuasR_1.6.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/quasr/tree/release - 3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/QuasR/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心