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QDNASEQ
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅QDNASEQ。
定量DNA测序染色体畸变
生物导体版本：3.0
定量DNA测序进行染色体畸变。基因组分为非重叠的固定尺寸垃圾箱，每个计数中的序列读数数量，并用同时进行二维斗牛士校正来调整序列可遵循性和GC含量，并过滤以去除基因组中的虚假区域。分割和调用的下游步骤分别通过包裹和CGHCALL实现。
作者：Ilari Scheinin [aut]，Daoud Sie [AUT，CRE]，Henrik Bengtsson [aut]
维护者：daoud sie
引用（从r内，输入引用（“ QDNASEQ”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ qdnaseq”）
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ qdnaseq”）
| R脚本 | QDNASEQ简介 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，dnaseq，，，，遗传学，，，，基因数，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.2.4 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（2年） |
| 执照 | GPL |
| 依靠 | R（> = 2.15.0） |
| 进口 | 图形，方法，统计，utils，矩阵（> = 0.9.4），r.utils（> = 1.28.4），生物酶（> = 2.18.0），CGHBASE（> = 1.18.0），CGHCALL（> = 2.18.0），DNACOPIGY（> = 1.32.0），rsamtools（> = 1.10.0） |
| 链接 | |
| 建议 | R.Cache（> = 0.9.0），消化，，，，降雪，，，，BSGENOME，，，，GenomeInfodB |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ccagc/qdnaseq |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | qdnaseq_1.2.4.tar.gz |
| Windows二进制 | qdnaseq_1.2.4.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | qdnaseq_1.2.4.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | qdnaseq_1.2.4.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/qdnaseq/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/qdnaseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
