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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PGSEA。

参数基因集富集分析

Bioconductor版本:3.0

参数分析的基因集富集

作者:凯尔Furge <凯尔。furge vai.org >和卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

维护人员:卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“PGSEA”)

PDF	R脚本	HOWTO: PGSEA
PDF	R脚本	HOWTO: PGSEA工作流示例
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议	GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GeneExpressionSignature
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	PGSEA_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	PGSEA_1.40.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	PGSEA_1.40.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	PGSEA_1.40.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/pgsea/tree/release - 3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/
包下载报告	下载数据