要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PAA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PAA.
Bioconductor版本:3.0
PAA导入单色(蛋白质)微阵列数据,该数据已保存在gpr文件格式-特别是ProtoArray数据。预处理(背景校正、批过滤、归一化)后,进行单变量特征预选(例如,使用“最小M统计量”方法-以下简称“mm”)。随后,进行多元特征选择以发现候选生物标志物。因此,可以使用基于频率的向后消除方法或集成特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱,包括用于结果检查和评估的几种不同的图。
作者:Michael Turewicz [aut, cre], Martin Eisenacher [ctb, cre]
维护者:Michael Turewicz < Michael。tuturewicz at rub.de>, Martin Eisenacher < Martin。Eisenacher在rub.de>
引文(从R内,输入引用(PAA)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PAA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (PAA)
R脚本 | PAA教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 分类,微阵列,OneChannel,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | BSD_3_clause + file LICENSE |
取决于 | R (>= 3.0.3),Rcpp(> = 0.10.6.1) |
进口 | e1071,limma,质量,mRMRe,randomForest,ROCR,股东价值分析 |
链接 | Rcpp |
建议 | BiocStyle,RUnit,BiocGenerics,vsn |
SystemRequirements | c++软件包随机丛林 |
增强了 | |
URL | http://www.medizinisches-proteom-center.de/PAA |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | PAA_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | PAA_1.0.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | PAA_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | PAA_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/PAA/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PAA/ |
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