要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MiRaGE”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见海市蜃楼.
Bioconductor版本:3.0
该包包含的功能推断靶基因调控miRNA,仅基于靶基因表达谱。
作者:Y-h。田口<标签在granular.com>
维护人员:Y-h。田口<标签在granular.com>
引文(从R内,输入引用(“海市蜃楼”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MiRaGE”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“海市蜃楼”)
R脚本 | 如何使用MiRaGE Package | |
参考手册 |
biocViews | GeneExpression,微阵列,RNASeq,圣人,测序,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R (>= 3.1.0),Biobase(> = 2.23.3) |
进口 | AnnotationDbi,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | seqinr(> = 3.0.7),biomaRt(> = 2.19.1),GenomicFeatures(> = 1.15.4),Biostrings(> = 2.31.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,miRNATarget,humanStemCell,IRanges,GenomicRanges(> = 1.8.3),BSgenome,beadarrayExampleData |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | MiRaGE_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | MiRaGE_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MiRaGE_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | MiRaGE_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MiRaGE/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MiRaGE/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |