安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MethylSeekR”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MethylSeekR。
Bioconductor版本:3.0
这是一个包从Bis-seq数据监管发现的地区
作者:卢卡斯汉堡,Dimos Gaidatzis,德克Schubeler和迈克尔·施
维护人员:卢卡斯汉堡<卢卡斯。汉堡在fmi.ch >
从内部引用(R,回车引用(“MethylSeekR”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MethylSeekR”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MethylSeekR”)
R脚本 | MethylSeekR | |
参考手册 |
biocViews | DNAMethylation,MethylSeq,测序,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(3年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | rtracklayer(> = 1.16.3),并行(> = 2.15.1),mhsmm(> = 0.4.4) |
进口 | IRanges(> = 1.16.3),BSgenome(> = 1.26.1),GenomicRanges(> = 1.10.5),geneplotter(> = 1.34.0)、图形(> = 2.15.2)grDevices(> = 2.15.2),并行(> = 2.15.2),数据(> = 2.15.2),跑龙套(> = 2.15.2) |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | methylPipe |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | MethylSeekR_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | MethylSeekR_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MethylSeekR_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | MethylSeekR_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/methylseekr/tree/release - 3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MethylSeekR/ |
包下载报告 | 下载数据 |