安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MethylSeekR”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

MethylSeekR

这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MethylSeekR

Bis-seq数据的分割

Bioconductor版本:3.0

这是一个包从Bis-seq数据监管发现的地区

作者:卢卡斯汉堡,Dimos Gaidatzis,德克Schubeler和迈克尔·施

维护人员:卢卡斯汉堡<卢卡斯。汉堡在fmi.ch >

从内部引用(R,回车引用(“MethylSeekR”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MethylSeekR”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MethylSeekR”)

PDF R脚本 MethylSeekR
PDF 参考手册

细节

biocViews DNAMethylation,MethylSeq,测序,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 rtracklayer(> = 1.16.3),并行(> = 2.15.1),mhsmm(> = 0.4.4)
进口 IRanges(> = 1.16.3),BSgenome(> = 1.26.1),GenomicRanges(> = 1.10.5),geneplotter(> = 1.34.0)、图形(> = 2.15.2)grDevices(> = 2.15.2),并行(> = 2.15.2),数据(> = 2.15.2),跑龙套(> = 2.15.2)
链接
建议 BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 methylPipe
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 MethylSeekR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 MethylSeekR_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MethylSeekR_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) MethylSeekR_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/methylseekr/tree/release - 3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MethylSeekR/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心