要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MSnID”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

MSnID

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MSnID

LC-MSn蛋白质组鉴定可信度的探索和评估实用程序。

Bioconductor版本:3.0

从mzIdentML(利用mzID包)或文本文件中提取MS/MS ID数据。在整理来自多个数据集的搜索结果后,它评估它们的识别质量并优化过滤条件,以实现识别的最大数量,同时不超过指定的错误发现率。还包含了一些实用工具来探索MS/MS结果,并评估错过和不规则的酶切割,质量测量精度等。

作者:Vlad Petyuk,由Laurent Gatto贡献

维护者:Vlad Petyuk < Petyuk at gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“MSnID”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MSnID”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MSnID”)

PDF R脚本 用于处理MS/MS标识的MSnID包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews MassSpectrometry蛋白质组学软件
版本 1.0.1
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),Rcpp
进口 MSnbase(> = 1.12.1),mzID(> = 1.3.5),R.cacheforeachdoParallel平行,reshape2、方法、迭代器data.tableBiobasemzR
链接
建议 BiocStylemsmsTestsggplot2RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MSnID_1.0.1.tar.gz
Windows二进制 MSnID_1.0.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MSnID_1.0.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) MSnID_1.0.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MSnID/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MSnID/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
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