要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见Harshlight.
Bioconductor版本:3.0
该包用于检测微阵列芯片上的扩展,扩散和紧凑的瑕疵。Harshlight自动标记芯片集合中的区域(affybatch对象),并返回更正后的affybatch对象,其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中相同探针值的中值代替。新版本将代入值作为整个矩阵处理,解决了内存问题。
作者:Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco
维护者:Maurizio Pellegrino
引文(从R内,输入引用(“Harshlight”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“Harshlight”)
R脚本 | Harshlight | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件 |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor | BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | affy,altcdfenvs,Biobase,统计,效用 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | Harshlight_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | Harshlight_1.38.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Harshlight_1.38.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | Harshlight_1.38.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/Harshlight/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Harshlight/ |
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