要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Harshlight

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见Harshlight

一种微阵列芯片的“校正化妆”程序

Bioconductor版本:3.0

该包用于检测微阵列芯片上的扩展,扩散和紧凑的瑕疵。Harshlight自动标记芯片集合中的区域(affybatch对象),并返回更正后的affybatch对象,其中有缺陷的区域用NAs或集合中其他芯片中相同探针值的中值代替。新版本将代入值作为整个矩阵处理,解决了内存问题。

作者:Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco

维护者:Maurizio Pellegrino

引文(从R内,输入引用(“Harshlight”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Harshlight”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“Harshlight”)

PDF R脚本 Harshlight
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel预处理质量控制ReportWriting软件
版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10)
进口 affyaltcdfenvsBiobase,统计,效用
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 Harshlight_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 Harshlight_1.38.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) Harshlight_1.38.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) Harshlight_1.38.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/Harshlight/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Harshlight/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心