要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htsfilter”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅htsfilter。
生物导体版本:3.0
该软件包实现了基于全局JACCARD相似性指数的复制转录组测序数据的过滤过程,以识别一个或多个实验条件下表达水平较低的基因。
作者:Andrea Rau,Melina Gallopin,Gilles Celeux和Florence Jaffrezic
维护者:Andrea rau
引用(从r内,输入引用(“ htsfilter”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ htsfilter”)
R脚本 | htsfilter小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(3年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法,生物酶(> = 2.16.0),R(> = 2.10.0) |
进口 | deseq(> = 1.8.3),EDGER(> = 2.6.12),deseq2(> = 1.2.8),基因组机,,,,iranges |
链接 | |
建议 | EDASEQ(> = 1.2.0) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | htsfilter_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | htsfilter_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | htsfilter_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | htsfilter_1.6.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/htsfilter/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/htsfilter/ |
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