要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htsfilter”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

htsfilter

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅htsfilter

滤波器复制的高通量转录组测序数据

生物导体版本:3.0

该软件包实现了基于全局JACCARD相似性指数的复制转录组测序数据的过滤过程,以识别一个或多个实验条件下表达水平较低的基因。

作者:Andrea Rau,Melina Gallopin,Gilles Celeux和Florence Jaffrezic

维护者:Andrea rau

引用(从r内,输入引用(“ htsfilter”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ htsfilter”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ htsfilter”)

PDF R脚本 htsfilter小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 艺术2.0
要看 方法,生物酶(> = 2.16.0),R(> = 2.10.0)
进口 deseq(> = 1.8.3),EDGER(> = 2.6.12),deseq2(> = 1.2.8),基因组机,,,,iranges
链接
建议 EDASEQ(> = 1.2.0)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 htsfilter_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 htsfilter_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) htsfilter_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) htsfilter_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/htsfilter/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/htsfilter/
软件包下载报告 下载统计

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