##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GlobalAncova")

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GlobalAncova．

计算组间差异基因表达的全局测试

Bioconductor版本:3.0

我们给出了以下论据来支持GlobalAncova方法:在适当的规范化之后，基因表达数据看起来相当对称，异常值不是真正的问题，因此最小二乘应该相当稳健。具有相互作用的ANCOVA产生饱和数据模型，例如每组和基因的平均值不同。协变量调整有助于纠正可能的选择偏差。方差同质性和不相关残差是不可预期的。普通最小二乘的应用给出无偏估计，但不再是最优估计(高斯-马尔科夫-艾特肯)。因此，由于相关性，使用经典的f检验是不合适的。然而，检验统计量反映了原假设的偏差。结合排列方法，经验显著性水平可以近似。或者，近似产生渐近的p值。该研究得到了德国BMBF的NGFN拨款01 GR 0459的支持。

作者:U. Mansmann, R. Meister, M. Hummel, R. Scheufele, S. Knueppel投稿

维护人员:Manuela Hummel

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("GlobalAncova")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GlobalAncova”)

PDF	R脚本	GlobalAncova.pdf
PDF	R脚本	GlobalAncovaDecomp.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，微阵列，OneChannel，通路，软件
版本	3.34.0
在Bioconductor公司	BioC 1.7 (R-2.2)(10.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法,corpcor，globaltest
进口	注释，AnnotationDbi
链接
建议	Biobase，注释，GO.db，KEGG.db，golubEsets，hu6800.db，vsn，GSEABase，Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	GlobalAncova_3.34.0.tar.gz
Windows二进制	GlobalAncova_3.34.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)	GlobalAncova_3.34.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	GlobalAncova_3.34.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GlobalAncova/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GlobalAncova/
软件包下载报告	下载数据