要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GWASTools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GWASTools.
Bioconductor版本:3.0
类,用于存储非常大的GWAS数据集和注释,以及用于GWAS数据清理和分析的函数。
作者:Stephanie M. Gogarten, Cathy Laurie, Tushar Bhangale, Matthew P. Conomos, Cecelia Laurie, Caitlin McHugh, Ian Painter,郑秀文,Jess Shen, Rohit Swarnkar, Adrienne Stilp
维护者:Stephanie M. Gogarten
引文(从R内,输入引用(“GWASTools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GWASTools”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GWASTools”)
R脚本 | GWASTools中的数据格式 | |
R脚本 | GWAS数据清洗 | |
R脚本 | 准备Affymetrix数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneticVariability,微阵列,质量控制,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 1.12.2 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobasencdf,gdsfmt |
进口 | 方法,DBI,RSQLite,GWASExactHW,DNAcopy,生存,三明治,航空航天,quantsmooth |
链接 | |
建议 | GWASdata,BiocGenerics,RUnit,SNPRelate,snpStats,VariantAnnotation |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | GWASdata |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GWASTools_1.12.2.tar.gz |
Windows二进制 | GWASTools_1.12.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GWASTools_1.12.2.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | GWASTools_1.12.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GWASTools/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GWASTools/ |
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