要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSRI”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GSRI.
Bioconductor版本:3.0
GSRI包估计基因集中差异表达基因的数量,利用基因集调控指数(GSRI)的概念。
作者:Julian Gehring, Kilian Bartholome, Clemens Kreutz, Jens Timmer
维护者:Julian Gehring < Julian。Gehring at embl.de>
引文(从R内,输入引用(“GSRI”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSRI”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GSRI”)
R脚本 | 介绍GSRI包:利用基因集调控指数估计调控效应 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,微阵列,软件,转录 |
版本 | 2.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.14.2),fdrtool |
进口 | 方法,图形,统计,utils,genefilter,Biobase,GSEABase,莱斯(> = 1.1.6) |
链接 | |
建议 | limma,hgu95av2.db |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行 |
URL | http://julian-gehring.github.com/GSRI/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GSRI_2.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | GSRI_2.14.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GSRI_2.14.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | GSRI_2.14.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GSRI/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GSRI/ |
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