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此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见GSEABase。

基因集合富集数据结构和方法

Bioconductor版本:3.0

这个包提供了支持基因集合富集分析(GSEA)的类和方法。

作者:Martin Morgan, Seth Falcon, Robert Gentleman

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSEABase”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GSEABase”)

PDF	R脚本	GSEABase简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),注释、方法、图(> = 1.37.2)
进口	AnnotationDbi,XML
链接
建议	hgu95av2.db,GO.db,org.Hs.eg.db,Rgraphviz,ReportingTools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AGDEX,BicARE,gCMAP,GSVAdata,npGSEA,承诺
进口我	类别,categoryCompare,cellHTS2,gCMAPWeb,GSRI,GSVA,HTSanalyzeR,PCpheno,phenoTest,承诺,ReportingTools
建议我	BiocCaseStudies,计,GlobalAncova,globaltest,GOstats,GSAR,GSEAlm,PGSEA,phenoTest
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	GSEABase_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	GSEABase_1.28.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	GSEABase_1.28.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	GSEABase_1.28.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GSEABase/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSEABase/
包下载报告	下载数据