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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ goexpress”）
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goexpress
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅goexpress。
使用基因本体学注释可视化微阵列和RNASEQ数据
生物导体版本：3.0
该软件包包含从微阵列或RNA-seq实验中可视化基因表达水平的方法，并提供了聚类分析，以识别具有表达水平最佳聚类的基因中的GO术语，从而最能聚类两个或多个预定义的样品组。表达数据集中存在的基因的注释是通过BiomArt软件包从Ensembl获得的。随机森林框架用于评估每个基因根据感兴趣的因素聚集样品的能力。最后，通过平均分别基因集的等级（替代得分）来汇总样品的级别（替代得分）来得分。ANOVA方法也可以作为替代性统计框架。
作者：Kevin Rue-Albrecht [AUT，CRE]，Paul A. McGettigan [CTB]，Belinda Hernandez [CTB]，David A. Magee [CTB]，Nicolas C. Nalpas [CTB]，Andrew Parnell [CTB]，Stephen V。
维护者：kevin rue-albrecht
引用（从r内，输入引用（“ goexpress”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ goexpress”）
| R脚本 | 用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，聚类，，，，datarepresentation，，，，差异性，，，，去，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，宏基因组学，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，途径，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，时间科，，，，转录，，，，可视化 |
| 版本 | 1.0.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（1。5年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | r（> = 3.0.2），网格，生物酶（> = 2.22.0） |
| 进口 | Biomart（> = 2.18.0），Stringr（> = 0.6.2），GGPLOT2（> = 0.9.0），rcolorbrewer（> = 1.0），GPLOTS（> = 2.13.0），Venndiagram（> = 1.6.5），Randomforest（> = 4.6） |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/kevinrue/goexpress-release |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | goexpress_1.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | goexpress_1.0.1.1.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | goexpress_1.0.1.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | goexpress_1.0.1.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/goexpress/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/goexpress/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
