安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOSemSim。
Bioconductor版本:3.0
蕾斯尼克提出的五个方法实现,Schlicker江,林和王分别估算语义相似之处。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,狗,鸡,黑猩猩,Coelicolor,大肠杆菌菌株K12的酒井法子,飞,刚,人类,疟疾,鼠,猪,猴,鼠,蠕虫,非洲爪蟾蜍,酵母,斑马鱼。
作者:Guangchuang余
维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“GOSemSim”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GOSemSim”)
R脚本 | 介绍GOSemSim | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 聚类,去,网络,通路,软件 |
版本 | 1.24.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(7年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.0.0) |
进口 | Rcpp,AnnotationDbi,GO.db |
链接 | Rcpp |
建议 | 剂量,clusterProfiler,org.Hs.eg.db,ChIPseeker,ReactomePA,BiocInstaller,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/GuangchuangYu/GOSemSim |
取决于我 | tRanslatome |
进口我 | clusterProfiler,剂量,Rcpi |
建议我 | ChIPseeker,ReactomePA,SemDist |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GOSemSim_1.24.1.tar.gz |
Windows二进制 | GOSemSim_1.24.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GOSemSim_1.24.1.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | GOSemSim_1.24.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/gosemsim/tree/release - 3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/ |
包下载报告 | 下载数据 |