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此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见GGtools。

用于基因表达遗传学分析的软件和数据

Bioconductor版本:3.0

用于基因表达和/或DNA甲基化遗传学分析的软件和数据

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GGtools”)

文档

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browseVignettes(“GGtools”)

PDF	R脚本	GGtools: eQTL鉴定软件
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本	5.2.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.14),GGBase(> = 3.19.7),data.table、并行
进口	方法,跑龙套,统计数据,BiocGenerics,snpStats,ff,Rsamtools,AnnotationDbi,Biobase,位,VariantAnnotation,hexbin,rtracklayer,Gvizstats4,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,迭代器,Biostrings,ROCR,biglm,ggplot2,reshape2
链接
建议	GGdata,illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608,乘,大气气溶胶,rmeta
SystemRequirements
增强了	MatrixEQTL,Homo.sapiens平行,foreach,doParallel,gwascat
URL
取决于我	ceu1kg,cgdv17,cheung2010,encoDnaseI,ggtut
进口我	ceuhm3
建议我	GGBase,hmyriB36,ind1KG
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	GGtools_5.2.0.tar.gz
Windows二进制	GGtools_5.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	GGtools_5.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	GGtools_5.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GGtools/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
包下载报告	下载数据