##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("DOQTL")

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DOQTL．

DO小鼠的基因分型和QTL定位

Bioconductor版本:3.0

DOQTL是为多样性离系小鼠和其他多亲本离系群体设计的定量性状位点(QTL)定位管道。该软件包从基因分型阵列读取数据，并使用隐马尔可夫模型(HMM)执行单倍型重建。然后使用来自HMM的单倍型概率执行链接映射。当有起始序列时，DOQTL可以利用单倍型重构将起始序列归入DO基因组并进行关联映射。

作者:丹尼尔·加蒂，卡尔·布罗曼，安德烈·沙巴林

维护者:丹尼尔·加蒂<丹。Gatti在jax.org>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("DOQTL")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“DOQTL”)

PDF	R脚本	利用多样性离系小鼠进行QTL定位
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability，遗传学，HiddenMarkovModel，单核苷酸多态性，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10.0)
进口	注释，annotationTools，biomaRt，Biobase，BiocGenerics，corpcor，GenomicRanges，hwriter，IRanges，mclust，MUGAExampleData，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，QTLRel，Rsamtools，RUnit，XML
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://do.jax.org
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	DOQTL_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	DOQTL_1.0.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)	DOQTL_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	DOQTL_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DOQTL/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DOQTL/
软件包下载报告	下载数据