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这个包是用于Bioconductor 3.0版本的;有关稳定的最新发布版本，请参阅dna。

DNase I足迹分析的DNase-seq数据

Bioconductor版本:3.0

“双击”的DNase-seq数据中的链特异性数字基因组足迹。累积Skellam分布函数(包' Skellam ')用于检测每个DNA链上相对符号的显著归一化计数差异。这样做是为了确定蛋白质结合足迹的侧翼。建议在运行DNaseR之前对映射的读取进行预处理(例如，质量检查和消除序列特异性偏差)。

作者:Pedro Madrigal

维护人员:Pedro Madrigal

安装

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文档

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PDF	R脚本	dna装饰图案
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学,软件,转录
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	GPL-2 +文件LICENSE
取决于	R (> = 2.10.0),BiocGenerics,S4Vectors,IRanges
进口	GenomeInfoDb,GenomicRanges,Rsamtools
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在你的R会话中使用这个包的说明。

包的来源	DNaseR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	DNaseR_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	DNaseR_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DNaseR_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DNaseR/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNaseR/
包下载报告	下载数据