要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ dmrforpairs”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

dmrforpairs

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅dmrforpairs

DMRFORPAIRS:使用阵列基甲基化曲线识别唯一样品之间差异甲基化区域

生物导体版本:3.0

DMRFORPAIRS(以前是DMR2+)允许研究人员在其甲基化剖面方面比较N> = 2个独特的样品。N唯一单样品的(成对)比较将DMRForpairs与其他现有管道区分开,因为这些通常会比较单个CPG基因座或基于区域的分析中的样品组。dmrforpairs将感兴趣的区域定义为基因组范围,彼此之间有足够的探针。一个区域中的探针可选地注释到同一功能类别。通过比较单个样品之间的每个区域内的甲基化值,并且(如果差异足够大)来评估差异甲基化,从而正式测试了该差异的统计显着性。

作者:Martin Rijlaarsdam [AUT,CRE],Yvonne VD Zwan [aut],Lambert Dorssers [aut],Leendert Looijenga [aut]

维护者:Martin Rijlaarsdam

引用(从r内,输入引用(“ dmrforpairs”)):

安装

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文档

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browsevignettes(“ dmrforpairs”)

PDF R脚本 dmrforpairs_vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,DNAMETHYLATY,,,,差甲基化,,,,微阵列,,,,报告写作,,,,软件,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.15.2),GVIZ(> = 1.2.1),R2HTML(> = 2.2.1),基因组机(> = 1.10.7),并行
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL http://www.martinrijlaarsdam.nlhttp://www.erasmusmc.nl/pathologie/research/lepo/3898639/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 dmrforpairs_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 dmrforpairs_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) dmrforpairs_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) dmrforpairs_1.2.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/dmrforpairs/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dmrforpairs/
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