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此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本，请参阅deseq2.。

基于负二氯分布的差异基因表达分析

Biocometiond版本：3.0

估计来自高通量测序测定的计数数据中的差异意义依赖性以及使用负二项式分布的模型的差异表达式测试

作者：迈克尔爱（HSPH波士顿），Simon Anders，Wolfgang Huber（Embl Heidelberg）

维护者：Michael Love

安装

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文件

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PDF.	r script.	使用“DESEQ2”包分析RNA-SEQ数据
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	chipseq.那不同的亚兴那基因表达那rnaseq.那智者那测序那软件
版本	1.6.3
在生物导体中以来	BIOC 2.12（R-3.0）（3年）
执照	GPL（> = 3）
依靠	S4Vectors.那绞喉那Genomicranges.那rcpp.（> = 0.10.1），rcpparmadillo（> = 0.3.4.4）
进口	生物根系（> = 0.7.5），BioBase.那生物相投那Genefilter.， 方法，Locfit.那Geneplotter.那ggplot2.那HMISC.
链接到	rcpp.那rcpparmadillo
建议	运行那贡献那kn那rcolorbrewer.那生物焦那呼吸道那帕西拉（> = 0.2.10），DESEQ.那VSN.
系统要求
加强
URL.
取决于我	Dexseq.那Fourcseq.那MLSEQ.那TCC.
进口我	Fourcseq.那htsfilter.那文学那ReportingTools.那Systempiper.那Topaseq.
建议我	生物根系那Compcoder.那困惑那吐
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	deseq2_1.6.3.tar.gz.
Windows二进制文件	deseq2_1.6.3.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.6（雪豹）	deseq2_1.6.3.tgz.
Mac OS x 10.9（mavericks）	deseq2_1.6.3.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/deseq2/tree/release-3.0
包短网址	http://biocidodder.org/packages/deseq2/
包裹下载报告	下载统计信息