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此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见CexoR。

揭示ChIP-exo复制中高分辨率蛋白质- dna相互作用的R包

Bioconductor版本:3.0

ChIP-exo复制中的链特异性峰对呼叫。累积Skellam分布函数(包“Skellam”)用于检测每个DNA链(峰对)对号的显著归一化计数差异。利用“idr”包估计了生物复制中重叠峰对的不可重复发现率。

作者:Pedro Madrigal

维护者:Pedro Madrigal

安装

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文档

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browseVignettes(“CexoR”)

PDF	R脚本	CexoR装饰图案
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学,测序,软件,转录
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	art -2.0 | GPL-2 + file LICENSE
取决于	R (> = 2.10.0),S4Vectors,IRanges
进口	Rsamtools,GenomeInfoDb,GenomicRanges,rtracklayer,印尼盾
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	CexoR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	CexoR_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	CexoR_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	CexoR_1.4.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/CexoR/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CexoR/
包下载报告	下载数据